《中国微生态学杂志》（月刊）创刊于1989年，由中华预防医学会、大连医科大学主办。本刊主要刊登有关国内外人体微生态学、动植物微生态学及分子水平的微生态学等各领域的基础研究、应用研究、发展动态、成果和技术方法，包括生态制品（人用、兽用、水产、环境等）的研究、正常微生物群与微环境的平衡关系以及微生态失调造成疾病的防治研究、实验室技术等，以及促进微生态学与生命科学各学科相关领域的学术交流。
《中国微生态学杂志》以马列主义、毛泽东思想、邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，贯彻党的教育方针和“双百方针”，理论联系实际，开展教育科学研究和学科基础理论研究，交流科技成果，促进学院教学、科研工作的发展，为教育改革和社会主义现代化建设做出贡献。
《中国微生态学杂志》获中华预防医学会系列期刊发行奖；中国科学引文数据库来源期刊；中国学术期刊综合评价数据来源期刊。
