《赣南医学院学报》是由赣南医学院主办，国内外公开发行的医学综合性学术期刊。创刊于1980年，刊名为《赣南医专学报》，内部资料，不定期出版，1987年12月经新闻出版总署批准，改为半年刊，公开发行，1989年改为《赣南医学院学报》季刊，2002年改为双月刊，大16开，逢双月底出版，国内统一刊号CN：36-1154/R，国际标准刊号ISSN：1001-5779。
《赣南医学院学报》自创刊以来，以坚持党的四项基本原则，贯彻党和国家的教育、科技、卫生工作方针，繁荣学术研究为宗旨，严格遵守有关法令、法规和条例，面向经济建设，及时反映、交流和推广我校及国内外医学科研及教育的新成果、新技术、新经验，促进医疗卫生事业的发展。
《赣南医学院学报》为《中国学术期刊（光盘版）》、《中国期刊网》《万方数据库-数字化期刊群》、《中文科技期刊数据库》全文收录期刊，为《中国学术期刊评价数据库》来源期刊。《赣南医学院学报》1997年获第二届江西省科技期刊先进科技期刊奖，2003年获首届《CAJ-CD规范》执行期刊奖，2008年获第三届江西省期刊版式设计奖，2009年获全国高校科技期刊编辑质量奖。
