《内蒙古农业大学学报》(自然科学版)(双月刊)创刊于1957年,是内蒙古高校中创办较早的学报,也是内蒙古创办较早的科技期刊,已有50年的办刊史,前身为《内蒙古畜牧兽医学院学报》和《内蒙古农牧学院学报》,1999年更名为《内蒙古农业大学学报》。以贯彻“双百”方针,坚持少数民族地区农业高校的办刊特色,促进学术交流,促进教学、科研和生产的发展,为内蒙古自治区的社会主义经济建设服务为办刊宗旨。设有“动物科学与医学”、“生态环境科学”、“植物品种资源”、“生物工程”、“食品工程”、“林业科学”、“植物保护”、“园艺科学”、“水利与土木工程”、“机电工程”、“林业工程”、“计算机及其应用”、“基础科学”等栏目,主要读者对象是国内农业高校的师生、国内外各科研单位的科技人员以及各级农牧业技术干部。
《内蒙古农业大学学报》(自然科学版)获全国高等学校自然科学学报;教育部科技期刊;内蒙古自治区科技期刊。