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《清华大学学报(自然科学版)》(月刊)1915年创刊,国内外公开发行。主要刊登理工科基础理论研究与实验研究学术论文,及时反映学术上有特色、代表学科前沿、当前国际上科学界关心的科技研究成果,推动学术交流,促进研究成果的产业化,发挥科学技术为及时生产力的作用。被多家国际性文献检索机构,如Ei、CA、MR、РЖ、INSPEC、Zbl等及国内多家全国性文献检索机构收录。在国内历次全国性科技期刊评比中均获一等奖,1999年建国50年评优活动中获“首届国家期刊奖”,2001年《清华大学学报(自然科学版)》以“双高”期刊进入“中国期刊方阵”,2002年获“第二届国家期刊奖”。
《清华大学学报(自然科学版)》获国家期刊奖、国家“双高”期刊、1992年以来历次省部级一等奖、及时、二届全国科技期刊一等奖、教育部期刊一等奖、第三届中国出版政府奖提名奖。